Het bereidt het baarmoederslijmvlies voor, voor de innesteling van de tot de eerste stadium, van de embryo's ontwikkelde bevruchte eicellen. Progesteron zorgt ervoor dat loopsheid/ krolsheid het proliferatiestadium overgaat in het secretiestadium. In het secretiestadium beïnvloedt progesteron ook de eventueel aanwezige zaadcellen op hun reis naar de eicel door de baarmoeder en maakt hen geschikt om de eicellen binnen te dringen.
Progesteron vermindert ook de prikkeling van de spieren rondom de baarmoeder, zodat een afstotingsreactie tegen de „vreemde“ embryo's wordt onderdrukt.
Tijdens de dracht bevordert progesteron samen met oestrogene hormonen, prolactine, cortisol, insuline en schildklierhormoon de vergroting van de melkklieren (tepels bij dieren).
De embryo's stoot een speciale stof uit: choriongonadotropine dat ervoor zorgt dat het gele lichaam progesteron blijft produceren, totdat het baarmoederslijmvlies deze functie kan overnemen.